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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_87874
Cell Name :  Shi2013_Fig6_B
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Brn3b+/-; Brn3a CKOAP/+
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 20%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2018-03-04
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  Shi2013_Fig6_B.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Genetic interactions between Brn3 transcription factors in retinal ganglion cell type specification.

Measurements
Soma Surface :  746.02 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  66
Number of Branches :  134
Overall Width :  120.63 μm
Overall Height :  131.07 μm
Overall Depth :  55 μm
Average Diameter :  2.1 μm
Total Length :  2627.83 μm
Total Surface :  17696.5 μm2
Total Volume :  10433.5 μm3
Max Euclidean Distance :  93.44 μm
Max Path Distance :  361.64 μm
Max Branch Order :  18
Average Contraction :  0.72
Total Fragmentation :  1537
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  83.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.42°
Fractal Dimension :  1.14

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