8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_124514
Cell Name :  Series029_3ok
Archive Name :  Hernandez-Garzon
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Putamen
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  fibrous astrocyte
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  120  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-10-01
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  Series029_3ok.pvec
Note :  Intraparenchimal Injection of lentiviral particles coding for beta-galactosidase (LacZ)

Reference Article
Related Article Reference :  Diffusion-weighted magnetic resonance spectroscopy enables cell-specific monitoring of astrocyte reactivity in vivo.

Measurements
Soma Surface :  76.05 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  416
Number of Branches :  834
Overall Width :  36.01 μm
Overall Height :  53.42 μm
Overall Depth :  41.66 μm
Average Diameter :  0.55 μm
Total Length :  4596.84 μm
Total Surface :  7115.13 μm2
Total Volume :  1622.18 μm3
Max Euclidean Distance :  43.89 μm
Max Path Distance :  135.94 μm
Max Branch Order :  48
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  5591
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  2.15
Average Bifurcation Angle Local :  60.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.13°
Fractal Dimension :  1.11

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website