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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_124509
Cell Name :  Series029_2ok
Archive Name :  Hernandez-Garzon
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Putamen
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  fibrous astrocyte
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  120  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-10-01
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  Series029_2ok.pvec
Note :  Intraparenchimal Injection of lentiviral particles coding for beta-galactosidase (LacZ)

Reference Article
Related Article Reference :  Diffusion-weighted magnetic resonance spectroscopy enables cell-specific monitoring of astrocyte reactivity in vivo.

Measurements
Soma Surface :  76.31 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  358
Number of Branches :  726
Overall Width :  33.21 μm
Overall Height :  51.4 μm
Overall Depth :  58.13 μm
Average Diameter :  0.58 μm
Total Length :  4198.23 μm
Total Surface :  7026.61 μm2
Total Volume :  1851.57 μm3
Max Euclidean Distance :  40.02 μm
Max Path Distance :  86 μm
Max Branch Order :  29
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  5108
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  57.81°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.53°
Fractal Dimension :  1.1

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