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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_124515
Cell Name :  Series008Cropped3ok
Archive Name :  Hernandez-Garzon
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Putamen
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  fibrous astrocyte
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  120  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-10-01
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  Series008Cropped3ok.pvec
Note :  Intraparenchimal Injection of lentiviral particles coding for beta-galactosidase (LacZ)

Reference Article
Related Article Reference :  Diffusion-weighted magnetic resonance spectroscopy enables cell-specific monitoring of astrocyte reactivity in vivo.

Measurements
Soma Surface :  18.08 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  1284
Number of Branches :  2571
Overall Width :  41.52 μm
Overall Height :  50.92 μm
Overall Depth :  52.03 μm
Average Diameter :  0.39 μm
Total Length :  8599.47 μm
Total Surface :  9192.42 μm2
Total Volume :  1601.68 μm3
Max Euclidean Distance :  42.95 μm
Max Path Distance :  121.72 μm
Max Branch Order :  84
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  9458
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  1.99
Average Bifurcation Angle Local :  70.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.29°
Fractal Dimension :  1.1

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