8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109681
Cell Name :  Series-9
Archive Name :  Putatunda_Hu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  HIV-1 T26 Transgenic
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-01-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Series-9.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult neurogenic deficits in HIV-1 Tg26 transgenic mice.

Measurements
Soma Surface :  349.14 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  11
Overall Width :  69.73 μm
Overall Height :  172.61 μm
Overall Depth :  9.64 μm
Average Diameter :  1.63 μm
Total Length :  598.63 μm
Total Surface :  3211.94 μm2
Total Volume :  1493.52 μm3
Max Euclidean Distance :  195.75 μm
Max Path Distance :  223.93 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  344
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.99
Average Bifurcation Angle Local :  43.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  31.41°
Fractal Dimension :  1.02

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