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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109689
Cell Name :  Series-2_1
Archive Name :  Putatunda_Hu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  HIV-1 T26 Transgenic
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-01-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Series-2_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult neurogenic deficits in HIV-1 Tg26 transgenic mice.

Measurements
Soma Surface :  147.58 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  9
Overall Width :  33.31 μm
Overall Height :  172.92 μm
Overall Depth :  23.43 μm
Average Diameter :  0.76 μm
Total Length :  390.71 μm
Total Surface :  931.71 μm2
Total Volume :  214.84 μm3
Max Euclidean Distance :  179.88 μm
Max Path Distance :  231.99 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  473
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  6.61
Average Bifurcation Angle Local :  103.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.87°
Fractal Dimension :  1.09

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