8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109674
Cell Name :  Series-1_3
Archive Name :  Putatunda_Hu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  HIV-1 T26 Transgenic
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-01-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Series-1_3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult neurogenic deficits in HIV-1 Tg26 transgenic mice.

Measurements
Soma Surface :  599.45 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  5
Overall Width :  25.97 μm
Overall Height :  171.79 μm
Overall Depth :  9.48 μm
Average Diameter :  1.37 μm
Total Length :  294.15 μm
Total Surface :  1725.5 μm2
Total Volume :  1486.08 μm3
Max Euclidean Distance :  182.12 μm
Max Path Distance :  231.74 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  295
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.48
Average Bifurcation Angle Local :  82.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  32.05°
Fractal Dimension :  1.05

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