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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109680
Cell Name :  Series-11_1
Archive Name :  Putatunda_Hu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  HIV-1 T26 Transgenic
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-01-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Series-11_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult neurogenic deficits in HIV-1 Tg26 transgenic mice.

Measurements
Soma Surface :  552.28 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  7
Overall Width :  41.44 μm
Overall Height :  172.31 μm
Overall Depth :  9.32 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  305.16 μm
Total Surface :  2023.8 μm2
Total Volume :  1192.83 μm3
Max Euclidean Distance :  185.99 μm
Max Path Distance :  210.68 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  150
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2.11
Average Bifurcation Angle Local :  48.29°
Average Bifurcation Angle Remote :  23.76°
Fractal Dimension :  1.02

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