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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_177324
Cell Name :  Sdk1-Ona9
Archive Name :  Krishnaswamy
Species Name :  mouse
Strain :  Sdk1CreER x Rosa26-LSL-ChR2-tdTomato
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  100.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  ON type, Alpha
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2022-01-06
Date of Upload :  2022-02-02
Persistence Vector :  Sdk1-Ona9.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The cell adhesion molecule Sdk1 shapes assembly of a retinal circuit that detects localized edges.

Measurements
Soma Surface :  4.55 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  59
Overall Width :  212.78 μm
Overall Height :  240.06 μm
Overall Depth :  2.51 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2999.49 μm
Total Surface :  2355.79 μm2
Total Volume :  147.24 μm3
Max Euclidean Distance :  169.03 μm
Max Path Distance :  249.76 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  5106
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  71.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.92°
Fractal Dimension :  1.04

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