8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_177319
Cell Name :  Sdk1-Ona8
Archive Name :  Krishnaswamy
Species Name :  mouse
Strain :  Sdk1CreER x Rosa26-LSL-ChR2-tdTomato
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  100.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  ON type, Alpha
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2022-01-06
Date of Upload :  2022-02-02
Persistence Vector :  Sdk1-Ona8.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The cell adhesion molecule Sdk1 shapes assembly of a retinal circuit that detects localized edges.

Measurements
Soma Surface :  9.55 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  39
Number of Branches :  82
Overall Width :  250.5 μm
Overall Height :  249.09 μm
Overall Depth :  3.25 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  3667.72 μm
Total Surface :  2880.62 μm2
Total Volume :  180.04 μm3
Max Euclidean Distance :  182.23 μm
Max Path Distance :  294.14 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  6330
Partition Asymmetry :  0.34
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  79.16°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.45°
Fractal Dimension :  1.04

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