8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_177314
Cell Name :  Sdk1-Ona5
Archive Name :  Krishnaswamy
Species Name :  mouse
Strain :  Sdk1CreER x Rosa26-LSL-ChR2-tdTomato
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  100.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  ON type, Alpha
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2022-01-06
Date of Upload :  2022-02-02
Persistence Vector :  Sdk1-Ona5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The cell adhesion molecule Sdk1 shapes assembly of a retinal circuit that detects localized edges.

Measurements
Soma Surface :  1.14 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  95
Overall Width :  55.84 μm
Overall Height :  76.4 μm
Overall Depth :  3.88 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1411.32 μm
Total Surface :  1108.45 μm2
Total Volume :  69.28 μm3
Max Euclidean Distance :  49.51 μm
Max Path Distance :  71.58 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  7964
Partition Asymmetry :  0.32
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  65.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.79°
Fractal Dimension :  1.12

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