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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_162015
Cell Name :  SW190701-07_Slide2_Slice2_30X_SC_ZStep1um_all_sm_600_5
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  superior colliculus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Contralateral projecting
Tertiary Cell Class :  Parafascicular nucleus(PF)-projecting
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-01-31
Date of Upload :  2021-12-20
Persistence Vector :  SW190701-07_Slide2_Slice2_30X_SC_ZStep1um_all_sm_600_5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Organization of the inputs and outputs of the mouse superior colliculus.

Measurements
Soma Surface :  4067.84 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  17
Overall Width :  755.87 μm
Overall Height :  1033.04 μm
Overall Depth :  52.32 μm
Average Diameter :  10.95 μm
Total Length :  4317.34 μm
Total Surface :  156003 μm2
Total Volume :  476517 μm3
Max Euclidean Distance :  598.77 μm
Max Path Distance :  612.68 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  304
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.84
Average Bifurcation Angle Local :  47.01°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.94°
Fractal Dimension :  1

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