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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161939
Cell Name :  SW190701-07_Slide2_Slice2_30X_SC_ZStep1um_all_sm_600_19
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  superior colliculus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Contralateral projecting
Tertiary Cell Class :  Parafascicular nucleus(PF)-projecting
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-01-31
Date of Upload :  2021-12-20
Persistence Vector :  SW190701-07_Slide2_Slice2_30X_SC_ZStep1um_all_sm_600_19.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Organization of the inputs and outputs of the mouse superior colliculus.

Measurements
Soma Surface :  6076.63 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  13
Overall Width :  414.63 μm
Overall Height :  915.42 μm
Overall Depth :  35.71 μm
Average Diameter :  8.47 μm
Total Length :  3231.04 μm
Total Surface :  87513.4 μm2
Total Volume :  193380 μm3
Max Euclidean Distance :  557.67 μm
Max Path Distance :  583.93 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  304
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.81
Average Bifurcation Angle Local :  47.88°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.11°
Fractal Dimension :  1

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