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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161950
Cell Name :  SW19032902_Sc_new_green_smooth_600_2
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  superior colliculus, centromedial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Laterodorsal (LD)-projecting
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-01-31
Date of Upload :  2021-12-20
Persistence Vector :  SW19032902_Sc_new_green_smooth_600_2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Organization of the inputs and outputs of the mouse superior colliculus.

Measurements
Soma Surface :  1254.72 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  26
Overall Width :  820.74 μm
Overall Height :  1093.12 μm
Overall Depth :  180.43 μm
Average Diameter :  6.33 μm
Total Length :  6730.19 μm
Total Surface :  136661 μm2
Total Volume :  238444 μm3
Max Euclidean Distance :  599.36 μm
Max Path Distance :  1996.23 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1347
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  73.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.94°
Fractal Dimension :  1.02

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