8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161963
Cell Name :  SW19032902_Sc_new_green_smooth_600_1
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  superior colliculus, medial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Laterodorsal (LD)-projecting
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-01-31
Date of Upload :  2021-12-20
Persistence Vector :  SW19032902_Sc_new_green_smooth_600_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Organization of the inputs and outputs of the mouse superior colliculus.

Measurements
Soma Surface :  1016.29 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  11
Overall Width :  781.94 μm
Overall Height :  1091.65 μm
Overall Depth :  88.91 μm
Average Diameter :  5.36 μm
Total Length :  4589.4 μm
Total Surface :  78016.9 μm2
Total Volume :  108859 μm3
Max Euclidean Distance :  599.64 μm
Max Path Distance :  752.88 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1353
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.61
Average Bifurcation Angle Local :  109.14°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.31°
Fractal Dimension :  1.01

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