8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161987
Cell Name :  SW190329-02red_t9-27_final_smooth_600_48
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  superior colliculus, centrolateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Reuniens nucleus (RE)-projecting
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-01-31
Date of Upload :  2021-12-20
Persistence Vector :  SW190329-02red_t9-27_final_smooth_600_48.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Organization of the inputs and outputs of the mouse superior colliculus.

Measurements
Soma Surface :  2121.51 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  19
Overall Width :  735.14 μm
Overall Height :  1091.08 μm
Overall Depth :  50.97 μm
Average Diameter :  5.43 μm
Total Length :  4240.68 μm
Total Surface :  74364.5 μm2
Total Volume :  108919 μm3
Max Euclidean Distance :  598.72 μm
Max Path Distance :  664.4 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  817
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.69
Average Bifurcation Angle Local :  64.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.48°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website