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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161983
Cell Name :  SW190329-02red_t9-27_final_smooth_600_43
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  superior colliculus, medial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Reuniens nucleus (RE)-projecting
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  red fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-01-31
Date of Upload :  2021-12-20
Persistence Vector :  SW190329-02red_t9-27_final_smooth_600_43.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Organization of the inputs and outputs of the mouse superior colliculus.

Measurements
Soma Surface :  1016.04 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  13
Overall Width :  701.62 μm
Overall Height :  996.11 μm
Overall Depth :  236.1 μm
Average Diameter :  4.59 μm
Total Length :  4482.69 μm
Total Surface :  67270.3 μm2
Total Volume :  84867.7 μm3
Max Euclidean Distance :  599.96 μm
Max Path Distance :  760.42 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  1200
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.66
Average Bifurcation Angle Local :  70.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.92°
Fractal Dimension :  1.03

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