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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108699
Cell Name :  SW161129-06A_1_17_40X_PFC_reconstruction_neuron_1
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  D2-Cre MORF mNeon
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  SW161129-06A_1_17_40X_PFC_reconstruction_neuron_1.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  1639.43 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  74
Number of Branches :  151
Overall Width :  378.14 μm
Overall Height :  443.38 μm
Overall Depth :  25.56 μm
Average Diameter :  2.88 μm
Total Length :  6574 μm
Total Surface :  57713.3 μm2
Total Volume :  53234.1 μm3
Max Euclidean Distance :  406.4 μm
Max Path Distance :  619.63 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1400
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2.85
Average Bifurcation Angle Local :  62.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.25°
Fractal Dimension :  1.03

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