8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108738
Cell Name :  SW150113-01RabiesPHALPFC_x772_y876_z296_7
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  infralimbic
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  SW150113-01RabiesPHALPFC_x772_y876_z296_7.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  1713.7 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  73
Number of Branches :  155
Overall Width :  250.23 μm
Overall Height :  365.03 μm
Overall Depth :  114.22 μm
Average Diameter :  2.55 μm
Total Length :  5685.2 μm
Total Surface :  42231.5 μm2
Total Volume :  38455.2 μm3
Max Euclidean Distance :  303.73 μm
Max Path Distance :  444.25 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1273
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2.23
Average Bifurcation Angle Local :  71.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.83°
Fractal Dimension :  1.03

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