8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108733
Cell Name :  SW150113-01RabiesPHALPFC_x772_y876_z296_12
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  infralimbic
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  SW150113-01RabiesPHALPFC_x772_y876_z296_12.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  770.84 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  88
Number of Branches :  181
Overall Width :  189.4 μm
Overall Height :  262.51 μm
Overall Depth :  73.97 μm
Average Diameter :  2.35 μm
Total Length :  4967.21 μm
Total Surface :  34248.4 μm2
Total Volume :  26207 μm3
Max Euclidean Distance :  175.46 μm
Max Path Distance :  411.23 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1146
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2.37
Average Bifurcation Angle Local :  66.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.1°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website