8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_183478
Cell Name :  STIM1KO_14week_VGLUT2_4_d
Archive Name :  Dhanya
Species Name :  mouse
Strain :  STIM1flox/flox; Ai14Tdtomatotd/+; PCP2Cre/+
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  3.5 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  cerebellar cortex
Tertiary Brain Region :  Purkinje layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Purkinje
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  STIM1 Knockout
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  35  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-04-18
Date of Upload :  2022-05-10
Persistence Vector :  STIM1KO_14week_VGLUT2_4_d.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Purkinje Neurons with Loss of STIM1 Exhibit Age-Dependent Changes in Gene Expression and Synaptic Components.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  9
Overall Width :  15.89 μm
Overall Height :  94.04 μm
Overall Depth :  1.88 μm
Average Diameter :  2.43 μm
Total Length :  129.45 μm
Total Surface :  990.46 μm2
Total Volume :  613.23 μm3
Max Euclidean Distance :  100.15 μm
Max Path Distance :  109.37 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  201
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  19.26°
Average Bifurcation Angle Remote :  29.08°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website