8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36601
Cell Name :  SOM20100118
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  GIN
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Martinotti
Tertiary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2014-11-26
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  SOM20100118.pvec
Note :  Slicing direction is roughly coronal

Reference Article
Related Article Reference :  Target-specific expression of presynaptic NMDA receptors in neocortical microcircuits.

Measurements
Soma Surface :  4851.38 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  65
Number of Branches :  136
Overall Width :  1323.79 μm
Overall Height :  968.34 μm
Overall Depth :  152 μm
Average Diameter :  2.18 μm
Total Length :  16111.2 μm
Total Surface :  113768 μm2
Total Volume :  70069.6 μm3
Max Euclidean Distance :  1264.07 μm
Max Path Distance :  1811.83 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1269
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2.06
Average Bifurcation Angle Local :  78.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.9°
Fractal Dimension :  1.01

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