8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_251903
Cell Name :  SOM-shell11
Archive Name :  Hioki
Species Name :  mouse
Strain :  SST-IRES-Cre(Ssttm2.1(cre)Zjh/J)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  84.0 days
Max Age :  112.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  claustrum
Tertiary Brain Region :  shell
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2022-12-15
Date of Upload :  2023-01-12
Persistence Vector :  SOM-shell11.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Preferential arborization of dendrites and axons of parvalbumin- and somatostatin-positive GABAergic neurons within subregions of the mouse claustrum.

Measurements
Soma Surface :  2214.09 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  358
Number of Branches :  722
Overall Width :  707.61 μm
Overall Height :  1203.21 μm
Overall Depth :  1141.97 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  86216 μm
Total Surface :  541711 μm2
Total Volume :  270856 μm3
Max Euclidean Distance :  1282.65 μm
Max Path Distance :  2119.22 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  12198
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  83.2°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.9°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website