8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_171118
Cell Name :  SNr_reconstructions_Figure_1f
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  76.0 days
Max Age :  76.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  27 grams
Max Weight :  27 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars reticulata
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  nigrothalamic
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2021-10-06
Date of Upload :  2021-12-20
Persistence Vector :  SNr_reconstructions_Figure_1f.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The mouse cortico-basal ganglia-thalamic network.

Measurements
Soma Surface :  906.42 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  6
Overall Width :  255.33 μm
Overall Height :  1414.35 μm
Overall Depth :  133.39 μm
Average Diameter :  10 μm
Total Length :  2620.9 μm
Total Surface :  82337.9 μm2
Total Volume :  205845 μm3
Max Euclidean Distance :  1064.39 μm
Max Path Distance :  1123.17 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  221
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  85.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.45°
Fractal Dimension :  1.02

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