8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08875
Cell Name :  SNc-080312-132
Archive Name :  Alzheimer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-02-03
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  SNc-080312-132.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal failure during high frequency stimulation of rat subthalamic nucleus.

Measurements
Soma Surface :  2375.92 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  18
Overall Width :  588.88 μm
Overall Height :  625.99 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.18 μm
Total Length :  2113.85 μm
Total Surface :  1195.34 μm2
Total Volume :  53.79 μm3
Max Euclidean Distance :  512.57 μm
Max Path Distance :  576.74 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  498
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  69.72°
Average Bifurcation Angle Remote :  46.62°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website