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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08884
Cell Name :  SNc-071214-118B
Archive Name :  Alzheimer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-02-03
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  SNc-071214-118B.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Axonal failure during high frequency stimulation of rat subthalamic nucleus.

Measurements
Soma Surface :  1608.75 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  11
Overall Width :  161.32 μm
Overall Height :  694.14 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.09 μm
Total Length :  2161.62 μm
Total Surface :  623.42 μm2
Total Volume :  14.57 μm3
Max Euclidean Distance :  596.75 μm
Max Path Distance :  691.49 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  606
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  65.08°
Average Bifurcation Angle Remote :  27.46°
Fractal Dimension :  1.02

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