8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_106285
Cell Name :  SM080902A3-1
Archive Name :  Markram
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  13.0 days
Max Age :  16.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 2/3 & 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 10% in xy, 10% in z
Not corrected
Objective Type :  water
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-09-28
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  SM080902A3-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological, electrophysiological, and synaptic properties of corticocallosal pyramidal cells in the neonatal rat neocortex.

Measurements
Soma Surface :  600.13 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  131
Number of Branches :  267
Overall Width :  510.36 μm
Overall Height :  404 μm
Overall Depth :  231.47 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  14843.4 μm
Total Surface :  13213.8 μm2
Total Volume :  1306.78 μm3
Max Euclidean Distance :  488.61 μm
Max Path Distance :  927.38 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  7646
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.85
Average Bifurcation Angle Local :  81.22°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.35°
Fractal Dimension :  1.07

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