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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78927
Cell Name :  SLICE-3_19
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  SLICE-3_19.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  215.82 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  17
Overall Width :  42.37 μm
Overall Height :  36.76 μm
Overall Depth :  5.09 μm
Average Diameter :  0.93 μm
Total Length :  243.26 μm
Total Surface :  710.61 μm2
Total Volume :  173.49 μm3
Max Euclidean Distance :  27.27 μm
Max Path Distance :  45.81 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  120
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  94.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.45°
Fractal Dimension :  1.07

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