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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78924
Cell Name :  SLICE-3_16
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  SLICE-3_16.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  650.28 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  14
Overall Width :  27.23 μm
Overall Height :  33.06 μm
Overall Depth :  3.57 μm
Average Diameter :  1.06 μm
Total Length :  188.47 μm
Total Surface :  632.49 μm2
Total Volume :  184.5 μm3
Max Euclidean Distance :  27.69 μm
Max Path Distance :  35.83 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  88
Partition Asymmetry :  0.25
Average Rall's Ratio :  1.53
Average Bifurcation Angle Local :  93.17°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.4°
Fractal Dimension :  1.08

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