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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78912
Cell Name :  SLICE-2_28
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  SLICE-2_28.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  805.37 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  28
Overall Width :  44.23 μm
Overall Height :  30.25 μm
Overall Depth :  4.79 μm
Average Diameter :  0.87 μm
Total Length :  316.54 μm
Total Surface :  878.51 μm2
Total Volume :  202.43 μm3
Max Euclidean Distance :  28.28 μm
Max Path Distance :  37.35 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  143
Partition Asymmetry :  0.25
Average Rall's Ratio :  1.74
Average Bifurcation Angle Local :  80.25°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.69°
Fractal Dimension :  1.06

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