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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78910
Cell Name :  SLICE-2_26
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  SLICE-2_26.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  964.91 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  32
Overall Width :  67.76 μm
Overall Height :  31.61 μm
Overall Depth :  8.42 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  433.92 μm
Total Surface :  1418.4 μm2
Total Volume :  385.46 μm3
Max Euclidean Distance :  47.72 μm
Max Path Distance :  67.3 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  191
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.93
Average Bifurcation Angle Local :  79.6°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.08°
Fractal Dimension :  1.07

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