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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78898
Cell Name :  SLICE-1_32
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  LPS-triggered
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  SLICE-1_32.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  484.15 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  0
Number of Branches :  5
Overall Width :  17.78 μm
Overall Height :  11.76 μm
Overall Depth :  2.05 μm
Average Diameter :  1.2 μm
Total Length :  55.34 μm
Total Surface :  206.97 μm2
Total Volume :  63.22 μm3
Max Euclidean Distance :  10.45 μm
Max Path Distance :  14.9 μm
Max Branch Order :  0
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  18
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  0
Average Bifurcation Angle Local : 
Average Bifurcation Angle Remote : 
Fractal Dimension :  1.05

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