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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78771
Cell Name :  SLICE-1_15
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  SLICE-1_15.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  TLR4-activated microglia require IFN-gamma to induce severe neuronal dysfunction and death in situ.

Measurements
Soma Surface :  297.78 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  21
Overall Width :  51.91 μm
Overall Height :  27.36 μm
Overall Depth :  5.4 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  204.99 μm
Total Surface :  630.99 μm2
Total Volume :  166.62 μm3
Max Euclidean Distance :  38.15 μm
Max Path Distance :  43.03 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  82
Partition Asymmetry :  0.12
Average Rall's Ratio :  1.78
Average Bifurcation Angle Local :  92.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.15°
Fractal Dimension :  1.06

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