8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_89912
Cell Name :  SEC6-CON4_C19
Archive Name :  Diniz
Species Name :  mouse
Strain :  Albino
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  environmental enrichment + Piry virus-infected
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  70  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 75% in z
Corrected 75%
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-12-12
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  SEC6-CON4_C19.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis of microglial changes in a mouse model of virus encephalitis: age and environmental influences.

Measurements
Soma Surface :  150.22 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  84
Overall Width :  50.3 μm
Overall Height :  51.84 μm
Overall Depth :  5.58 μm
Average Diameter :  0.64 μm
Total Length :  524.84 μm
Total Surface :  1081.18 μm2
Total Volume :  192.9 μm3
Max Euclidean Distance :  37.14 μm
Max Path Distance :  59.51 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  608
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.61
Average Bifurcation Angle Local :  59.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.7°
Fractal Dimension :  1.09

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website