8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_51710
Cell Name :  SDM_Purkinje_KO1
Archive Name :  DeMunter
Species Name :  mouse
Strain :  Swiss-Webster
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  cerebellar cortex
Tertiary Brain Region :  Purkinje layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Purkinje
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Nestin-Mfp2 knockout
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2016-01-04
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  SDM_Purkinje_KO1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Early-onset Purkinje cell dysfunction underlies cerebellar ataxia in peroxisomal multifunctional protein-2 deficiency.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  287
Number of Branches :  575
Overall Width :  163.07 μm
Overall Height :  197.61 μm
Overall Depth :  4.59 μm
Average Diameter :  1.65 μm
Total Length :  6471.57 μm
Total Surface :  34315.7 μm2
Total Volume :  17848.9 μm3
Max Euclidean Distance :  248.96 μm
Max Path Distance :  266.46 μm
Max Branch Order :  24
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  1582
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  80.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.61°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website