8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_80044
Cell Name :  SCA6_P10_C5
Archive Name :  Watt
Species Name :  mouse
Strain :  SCA6-84Q/84Q
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  10.0 days
Max Age :  10.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  vermis
Tertiary Brain Region :  lobule III, apex
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Purkinje
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  spinocerebellar ataxia type 6 model
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-29
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  SCA6_P10_C5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Transient cerebellar alterations during development prior to obvious motor phenotype in a mouse model of spinocerebellar ataxia type 6.

Measurements
Soma Surface :  109.33 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  95
Number of Branches :  191
Overall Width :  27.58 μm
Overall Height :  47.65 μm
Overall Depth :  7.96 μm
Average Diameter :  0.56 μm
Total Length :  573.83 μm
Total Surface :  1031.53 μm2
Total Volume :  216.78 μm3
Max Euclidean Distance :  45.44 μm
Max Path Distance :  55.48 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  422
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.64
Average Bifurcation Angle Local :  76.28°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.46°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website