8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_124644
Cell Name :  S9_1_1_2
Archive Name :  Hernandez-Garzon
Species Name :  mouse
Strain :  Swiss-Webster
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Protoplasmic
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in utero
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Brainbow
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  90  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-10-01
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  S9_1_1_2.pvec
Note :  Electroporation of MAGIC markers at E13

Reference Article
Related Article Reference :  Cortical astrocytes develop in a plastic manner at both clonal and cellular levels.

Measurements
Soma Surface :  184.94 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  795
Number of Branches :  1597
Overall Width :  42.51 μm
Overall Height :  70.52 μm
Overall Depth :  47.82 μm
Average Diameter :  0.52 μm
Total Length :  8677.43 μm
Total Surface :  12432.7 μm2
Total Volume :  3816.42 μm3
Max Euclidean Distance :  51.62 μm
Max Path Distance :  136.71 μm
Max Branch Order :  69
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  8970
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2.04
Average Bifurcation Angle Local :  51.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.18°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website