8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109056
Cell Name :  S7-rebuilt
Archive Name :  Vicini
Species Name :  mouse
Strain :  JAX 005582
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  40.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Status epilepticus
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2019-04-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  S7-rebuilt.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electroconvulsive Shock Enhances Responsive Motility and Purinergic Currents in Microglia in the Mouse Hippocampus.

Measurements
Soma Surface :  146.48 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  46
Overall Width :  8.85 μm
Overall Height :  65.73 μm
Overall Depth :  31.88 μm
Average Diameter :  1.21 μm
Total Length :  315.9 μm
Total Surface :  1216.71 μm2
Total Volume :  469.7 μm3
Max Euclidean Distance :  42.5 μm
Max Path Distance :  49.81 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  907
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  50.85°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.02°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website