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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109058
Cell Name :  S5-rebuilt
Archive Name :  Vicini
Species Name :  mouse
Strain :  JAX 005582
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  40.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Status epilepticus
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2019-04-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  S5-rebuilt.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electroconvulsive Shock Enhances Responsive Motility and Purinergic Currents in Microglia in the Mouse Hippocampus.

Measurements
Soma Surface :  81.71 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  15
Overall Width :  5.3 μm
Overall Height :  39.23 μm
Overall Depth :  17.15 μm
Average Diameter :  1.47 μm
Total Length :  131.19 μm
Total Surface :  605.9 μm2
Total Volume :  299.37 μm3
Max Euclidean Distance :  28.38 μm
Max Path Distance :  33.51 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  367
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  2.23
Average Bifurcation Angle Local :  35.36°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.62°
Fractal Dimension :  1.03

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