8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_307411
Cell Name :  S409
Archive Name :  Jing_Jiang
Species Name :  mouse
Strain :  GlyT2-GFP; SST-Cre:Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  22.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  cochlear nucleus
Tertiary Brain Region :  ventral
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  glycinergic
Tertiary Cell Class :  D-stellate, GlyT2-positive, Somatostatin (SOM)-positive
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2025-09-25
Date of Upload :  2025-11-05
Persistence Vector :  S409.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Molecular logic for cellular specializations that initiate the auditory parallel processing pathways.

Measurements
Soma Surface :  1734.46 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  99
Overall Width :  319.88 μm
Overall Height :  481.87 μm
Overall Depth :  67.54 μm
Average Diameter :  1.1 μm
Total Length :  4442.84 μm
Total Surface :  15713.3 μm2
Total Volume :  4870.02 μm3
Max Euclidean Distance :  331.47 μm
Max Path Distance :  752.17 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1145
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  92.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.54°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website