8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_115849
Cell Name :  S1KO_31
Archive Name :  DeFelipe
Species Name :  mouse
Strain :  Beta2-/- mutant
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  parallel to the cortical surface
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-05-29
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  S1KO_31.pvec
Note :  mice lacking the Beta2-subunit of nAChR

Reference Article
Related Article Reference :  Alterations of cortical pyramidal neurons in mice lacking high-affinity nicotinic receptors.

Measurements
Soma Surface :  418.63 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  59
Overall Width :  133.04 μm
Overall Height :  190.67 μm
Overall Depth :  49.06 μm
Average Diameter :  0.2 μm
Total Length :  2049.06 μm
Total Surface :  1287.46 μm2
Total Volume :  64.37 μm3
Max Euclidean Distance :  117.02 μm
Max Path Distance :  144.86 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  810
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  62.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.03°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website