8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_162524
Cell Name :  RSL5_10132020
Archive Name :  Ahmed
Species Name :  mouse
Strain :  Grp-KH288-Cre
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  42.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Retrosplenial area
Tertiary Brain Region :  granular, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Regular spiking
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, streptavidin-488
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2021-08-28
Date of Upload :  2021-09-29
Persistence Vector :  RSL5_10132020.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Thalamus and claustrum control parallel layer 1 circuits in retrosplenial cortex.

Measurements
Soma Surface :  366.76 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  98
Overall Width :  231.14 μm
Overall Height :  347.87 μm
Overall Depth :  222.33 μm
Average Diameter :  0.76 μm
Total Length :  6413.46 μm
Total Surface :  16259.1 μm2
Total Volume :  3597.13 μm3
Max Euclidean Distance :  284.93 μm
Max Path Distance :  515 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  3327
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  2.15
Average Bifurcation Angle Local :  97.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.29°
Fractal Dimension :  1.05

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