8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02654
Cell Name :  RA080304-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Mag-indo-1 AM
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  RA080304-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits

Measurements
Soma Surface :  1129.44 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  86
Number of Branches :  181
Overall Width :  236.76 μm
Overall Height :  895.99 μm
Overall Depth :  37.5 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  14082 μm
Total Surface :  14384.9 μm2
Total Volume :  1815.02 μm3
Max Euclidean Distance :  711.19 μm
Max Path Distance :  1188.18 μm
Max Branch Order :  27
Average Contraction :  0.75
Total Fragmentation :  7297
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.51
Average Bifurcation Angle Local :  75.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.1°
Fractal Dimension :  1.08

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website