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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148646
Cell Name :  R53_PFC_S5_C4
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  36.0 days
Max Age :  36.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  133 grams
Max Weight :  133 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 heterozygous
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R53_PFC_S5_C4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  668.55 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  33
Overall Width :  131.18 μm
Overall Height :  194.51 μm
Overall Depth :  94.38 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  1917.95 μm
Total Surface :  1144.83 μm2
Total Volume :  54.38 μm3
Max Euclidean Distance :  178.66 μm
Max Path Distance :  190.14 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  557
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  66.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.27°
Fractal Dimension :  1.02

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