8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148555
Cell Name :  R27_PFC_S5_C1
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  41.0 days
Max Age :  41.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  156 grams
Max Weight :  156 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R27_PFC_S5_C1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  616.44 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  28
Overall Width :  125.55 μm
Overall Height :  141.97 μm
Overall Depth :  109.75 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  1193.8 μm
Total Surface :  712.58 μm2
Total Volume :  33.85 μm3
Max Euclidean Distance :  150.15 μm
Max Path Distance :  160.05 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  431
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  68.27°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.6°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website