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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148594
Cell Name :  R26_PFC_S3_C2
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  41.0 days
Max Age :  41.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  166 grams
Max Weight :  166 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R26_PFC_S3_C2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  760.26 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  45
Overall Width :  193 μm
Overall Height :  219.86 μm
Overall Depth :  100.68 μm
Average Diameter :  0.2 μm
Total Length :  2560.52 μm
Total Surface :  1592.78 μm2
Total Volume :  81.61 μm3
Max Euclidean Distance :  177.83 μm
Max Path Distance :  197.43 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  949
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  2.09
Average Bifurcation Angle Local :  76.38°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.55°
Fractal Dimension :  1.03

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