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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148666
Cell Name :  R26_PFC_S2_C2
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  41.0 days
Max Age :  41.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  166 grams
Max Weight :  166 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R26_PFC_S2_C2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  577.15 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  38
Overall Width :  126.8 μm
Overall Height :  218.66 μm
Overall Depth :  125.32 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  1746 μm
Total Surface :  1042.19 μm2
Total Volume :  49.5 μm3
Max Euclidean Distance :  134.01 μm
Max Path Distance :  172.39 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  682
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  83.49°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.03°
Fractal Dimension :  1.05

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