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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148656
Cell Name :  R25_PFC_S7_C4
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  41.0 days
Max Age :  41.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  211 grams
Max Weight :  211 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R25_PFC_S7_C4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  752.01 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  55
Overall Width :  169.42 μm
Overall Height :  255.44 μm
Overall Depth :  98.92 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  2227.85 μm
Total Surface :  1329.81 μm2
Total Volume :  63.17 μm3
Max Euclidean Distance :  215.13 μm
Max Path Distance :  245.7 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  627
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  75.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.63°
Fractal Dimension :  1.03

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