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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148635
Cell Name :  R24_PFC_S5_C9b
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  41.0 days
Max Age :  41.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  186 grams
Max Weight :  186 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 heterozygous
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R24_PFC_S5_C9b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  599.21 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  11
Overall Width :  41.61 μm
Overall Height :  116.52 μm
Overall Depth :  47.21 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  369.14 μm
Total Surface :  220.34 μm2
Total Volume :  10.47 μm3
Max Euclidean Distance :  137.21 μm
Max Path Distance :  154.95 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  129
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  64.72°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.36°
Fractal Dimension :  1.02

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