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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148575
Cell Name :  R1_PFC_S8_C2
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  34.0 days
Max Age :  34.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  165 grams
Max Weight :  165 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R1_PFC_S8_C2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  514.45 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  38
Overall Width :  118.19 μm
Overall Height :  182.13 μm
Overall Depth :  93.26 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  1489.95 μm
Total Surface :  889.36 μm2
Total Volume :  42.24 μm3
Max Euclidean Distance :  140.09 μm
Max Path Distance :  173.44 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  626
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  68.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.54°
Fractal Dimension :  1.04

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